Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmod1Q8BVA4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms