Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pggt1bQ8BUY9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms