Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms