Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTQ0

PcgF3, Polycomb group RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcgF3Q8BTQ0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PcgF3Q8BTQ0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms