Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSS9

Ppfia2, Liprin-alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia2Q8BSS9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ppfia2Q8BSS9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ppfia2Q8BSS9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ppfia2Q8BSS9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ppfia2Q8BSS9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ppfia2Q8BSS9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ppfia2Q8BSS9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ppfia2Q8BSS9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ppfia2Q8BSS9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ppfia2Q8BSS9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ppfia2Q8BSS9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppfia2Q8BSS9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppfia2Q8BSS9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppfia2Q8BSS9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppfia2Q8BSS9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppfia2Q8BSS9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppfia2Q8BSS9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppfia2Q8BSS9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppfia2Q8BSS9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppfia2Q8BSS9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppfia2Q8BSS9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppfia2Q8BSS9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppfia2Q8BSS9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppfia2Q8BSS9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppfia2Q8BSS9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppfia2Q8BSS9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppfia2Q8BSS9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppfia2Q8BSS9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppfia2Q8BSS9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppfia2Q8BSS9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppfia2Q8BSS9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppfia2Q8BSS9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppfia2Q8BSS9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppfia2Q8BSS9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppfia2Q8BSS9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms