Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gga3Q8BMI3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms