Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJN4

Fndc9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc9Q8BJN4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc9Q8BJN4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms