Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII3

D130040H23Rik, RIKEN cDNA D130040H23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130040H23RikQ8BII3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
D130040H23RikQ8BII3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
D130040H23RikQ8BII3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
D130040H23RikQ8BII3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
D130040H23RikQ8BII3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
D130040H23RikQ8BII3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms