Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gabra5Q8BHJ7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gabra5Q8BHJ7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gabra5Q8BHJ7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gabra5Q8BHJ7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gabra5Q8BHJ7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gabra5Q8BHJ7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gabra5Q8BHJ7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gabra5Q8BHJ7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gabra5Q8BHJ7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gabra5Q8BHJ7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gabra5Q8BHJ7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gabra5Q8BHJ7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gabra5Q8BHJ7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gabra5Q8BHJ7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gabra5Q8BHJ7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gabra5Q8BHJ7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gabra5Q8BHJ7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gabra5Q8BHJ7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gabra5Q8BHJ7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gabra5Q8BHJ7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gabra5Q8BHJ7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gabra5Q8BHJ7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gabra5Q8BHJ7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gabra5Q8BHJ7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gabra5Q8BHJ7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gabra5Q8BHJ7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gabra5Q8BHJ7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gabra5Q8BHJ7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gabra5Q8BHJ7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gabra5Q8BHJ7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gabra5Q8BHJ7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gabra5Q8BHJ7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gabra5Q8BHJ7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gabra5Q8BHJ7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gabra5Q8BHJ7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gabra5Q8BHJ7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gabra5Q8BHJ7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gabra5Q8BHJ7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gabra5Q8BHJ7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gabra5Q8BHJ7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gabra5Q8BHJ7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gabra5Q8BHJ7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gabra5Q8BHJ7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gabra5Q8BHJ7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gabra5Q8BHJ7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gabra5Q8BHJ7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gabra5Q8BHJ7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gabra5Q8BHJ7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gabra5Q8BHJ7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gabra5Q8BHJ7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gabra5Q8BHJ7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gabra5Q8BHJ7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gabra5Q8BHJ7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gabra5Q8BHJ7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gabra5Q8BHJ7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms