Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe23Q8BGW3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms