Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms