Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms