Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG39

Sv2b, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2bQ8BG39 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms