Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW9

H2-M10.2, Histocompatibility 2, M region locus 10.2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.2Q85ZW9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-M10.2Q85ZW9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M10.2Q85ZW9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M10.2Q85ZW9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M10.2Q85ZW9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M10.2Q85ZW9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M10.2Q85ZW9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M10.2Q85ZW9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M10.2Q85ZW9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M10.2Q85ZW9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M10.2Q85ZW9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M10.2Q85ZW9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M10.2Q85ZW9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M10.2Q85ZW9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M10.2Q85ZW9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M10.2Q85ZW9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M10.2Q85ZW9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M10.2Q85ZW9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M10.2Q85ZW9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M10.2Q85ZW9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M10.2Q85ZW9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M10.2Q85ZW9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M10.2Q85ZW9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M10.2Q85ZW9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M10.2Q85ZW9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
H2-M10.2Q85ZW9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
H2-M10.2Q85ZW9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
H2-M10.2Q85ZW9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
H2-M10.2Q85ZW9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M10.2Q85ZW9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms