Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

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Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Atg4cQ811C2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Atg4cQ811C2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Atg4cQ811C2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Atg4cQ811C2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Atg4cQ811C2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atg4cQ811C2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atg4cQ811C2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atg4cQ811C2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atg4cQ811C2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atg4cQ811C2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atg4cQ811C2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Atg4cQ811C2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Atg4cQ811C2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atg4cQ811C2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Atg4cQ811C2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg4cQ811C2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg4cQ811C2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg4cQ811C2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg4cQ811C2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg4cQ811C2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg4cQ811C2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg4cQ811C2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg4cQ811C2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg4cQ811C2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg4cQ811C2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg4cQ811C2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atg4cQ811C2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atg4cQ811C2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atg4cQ811C2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atg4cQ811C2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atg4cQ811C2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atg4cQ811C2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atg4cQ811C2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atg4cQ811C2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atg4cQ811C2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Atg4cQ811C2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atg4cQ811C2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atg4cQ811C2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atg4cQ811C2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Atg4cQ811C2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atg4cQ811C2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atg4cQ811C2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atg4cQ811C2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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