Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc172Q810N9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms