Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmem39bQ810L4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmem39bQ810L4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmem39bQ810L4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmem39bQ810L4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmem39bQ810L4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmem39bQ810L4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmem39bQ810L4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmem39bQ810L4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmem39bQ810L4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmem39bQ810L4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmem39bQ810L4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmem39bQ810L4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmem39bQ810L4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmem39bQ810L4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmem39bQ810L4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmem39bQ810L4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmem39bQ810L4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmem39bQ810L4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmem39bQ810L4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmem39bQ810L4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmem39bQ810L4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmem39bQ810L4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmem39bQ810L4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmem39bQ810L4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmem39bQ810L4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmem39bQ810L4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmem39bQ810L4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmem39bQ810L4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmem39bQ810L4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmem39bQ810L4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmem39bQ810L4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmem39bQ810L4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmem39bQ810L4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmem39bQ810L4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmem39bQ810L4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmem39bQ810L4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmem39bQ810L4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmem39bQ810L4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmem39bQ810L4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmem39bQ810L4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmem39bQ810L4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmem39bQ810L4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmem39bQ810L4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmem39bQ810L4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmem39bQ810L4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmem39bQ810L4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmem39bQ810L4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmem39bQ810L4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmem39bQ810L4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmem39bQ810L4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmem39bQ810L4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmem39bQ810L4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmem39bQ810L4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmem39bQ810L4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmem39bQ810L4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmem39bQ810L4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmem39bQ810L4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmem39bQ810L4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmem39bQ810L4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmem39bQ810L4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmem39bQ810L4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmem39bQ810L4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmem39bQ810L4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmem39bQ810L4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmem39bQ810L4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmem39bQ810L4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmem39bQ810L4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmem39bQ810L4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmem39bQ810L4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmem39bQ810L4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmem39bQ810L4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmem39bQ810L4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmem39bQ810L4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmem39bQ810L4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmem39bQ810L4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmem39bQ810L4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmem39bQ810L4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmem39bQ810L4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmem39bQ810L4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem39bQ810L4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem39bQ810L4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem39bQ810L4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem39bQ810L4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem39bQ810L4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem39bQ810L4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem39bQ810L4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem39bQ810L4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem39bQ810L4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem39bQ810L4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem39bQ810L4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem39bQ810L4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem39bQ810L4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem39bQ810L4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem39bQ810L4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem39bQ810L4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem39bQ810L4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem39bQ810L4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem39bQ810L4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem39bQ810L4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms