Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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