Protein–RNA interactions for Protein: Q80WM4

Hapln4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hapln4Q80WM4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms