Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Pcsk9Q80W65 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Pcsk9Q80W65 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Pcsk9Q80W65 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Pcsk9Q80W65 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Pcsk9Q80W65 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Pcsk9Q80W65 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Pcsk9Q80W65 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Pcsk9Q80W65 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pcsk9Q80W65 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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