Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ube3cQ80U95 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ube3cQ80U95 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ube3cQ80U95 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ube3cQ80U95 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ube3cQ80U95 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ube3cQ80U95 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ube3cQ80U95 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ube3cQ80U95 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ube3cQ80U95 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ube3cQ80U95 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ube3cQ80U95 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ube3cQ80U95 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ube3cQ80U95 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ube3cQ80U95 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ube3cQ80U95 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ube3cQ80U95 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ube3cQ80U95 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ube3cQ80U95 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ube3cQ80U95 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ube3cQ80U95 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ube3cQ80U95 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ube3cQ80U95 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ube3cQ80U95 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ube3cQ80U95 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ube3cQ80U95 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ube3cQ80U95 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ube3cQ80U95 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ube3cQ80U95 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ube3cQ80U95 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ube3cQ80U95 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms