Protein–RNA interactions for Protein: Q80TT8

Cul9, Cullin-9, mousemouse

Predictions only

Length 1,865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul9Q80TT8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cul9Q80TT8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cul9Q80TT8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cul9Q80TT8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cul9Q80TT8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cul9Q80TT8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cul9Q80TT8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cul9Q80TT8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cul9Q80TT8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cul9Q80TT8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cul9Q80TT8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cul9Q80TT8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cul9Q80TT8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cul9Q80TT8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Cul9Q80TT8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cul9Q80TT8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cul9Q80TT8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cul9Q80TT8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cul9Q80TT8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cul9Q80TT8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cul9Q80TT8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cul9Q80TT8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cul9Q80TT8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cul9Q80TT8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cul9Q80TT8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cul9Q80TT8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cul9Q80TT8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cul9Q80TT8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cul9Q80TT8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cul9Q80TT8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cul9Q80TT8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cul9Q80TT8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cul9Q80TT8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cul9Q80TT8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cul9Q80TT8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cul9Q80TT8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Cul9Q80TT8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cul9Q80TT8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cul9Q80TT8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cul9Q80TT8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cul9Q80TT8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cul9Q80TT8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cul9Q80TT8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cul9Q80TT8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cul9Q80TT8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cul9Q80TT8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cul9Q80TT8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Cul9Q80TT8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Cul9Q80TT8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cul9Q80TT8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cul9Q80TT8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cul9Q80TT8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cul9Q80TT8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cul9Q80TT8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cul9Q80TT8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cul9Q80TT8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cul9Q80TT8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cul9Q80TT8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cul9Q80TT8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cul9Q80TT8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cul9Q80TT8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cul9Q80TT8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cul9Q80TT8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cul9Q80TT8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cul9Q80TT8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cul9Q80TT8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cul9Q80TT8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cul9Q80TT8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cul9Q80TT8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cul9Q80TT8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cul9Q80TT8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cul9Q80TT8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cul9Q80TT8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cul9Q80TT8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Cul9Q80TT8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cul9Q80TT8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cul9Q80TT8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cul9Q80TT8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cul9Q80TT8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Cul9Q80TT8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cul9Q80TT8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cul9Q80TT8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cul9Q80TT8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cul9Q80TT8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cul9Q80TT8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cul9Q80TT8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cul9Q80TT8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cul9Q80TT8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cul9Q80TT8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cul9Q80TT8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cul9Q80TT8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cul9Q80TT8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Cul9Q80TT8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cul9Q80TT8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cul9Q80TT8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cul9Q80TT8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cul9Q80TT8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cul9Q80TT8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cul9Q80TT8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Cul9Q80TT8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms