Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92 ms