Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms