Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Actn1Q7TPR4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms