Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMM8

Parp16, Mono [ADP-ribose] polymerase PARP16, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp16Q7TMM8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Parp16Q7TMM8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Parp16Q7TMM8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Parp16Q7TMM8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Parp16Q7TMM8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp16Q7TMM8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms