Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms