Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Smim12Q78RX3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim12Q78RX3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim12Q78RX3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim12Q78RX3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim12Q78RX3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim12Q78RX3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Smim12Q78RX3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim12Q78RX3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim12Q78RX3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim12Q78RX3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Smim12Q78RX3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Smim12Q78RX3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Smim12Q78RX3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Smim12Q78RX3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Smim12Q78RX3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Smim12Q78RX3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Smim12Q78RX3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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