Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eci3Q78JN3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms