Protein–RNA interactions for Protein: Q78J03

Msrb2, Methionine-R-sulfoxide reductase B2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msrb2Q78J03 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Msrb2Q78J03 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms