Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU7

Gypc, Glycophorin-C, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypcQ78HU7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GypcQ78HU7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GypcQ78HU7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GypcQ78HU7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GypcQ78HU7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GypcQ78HU7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GypcQ78HU7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GypcQ78HU7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GypcQ78HU7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GypcQ78HU7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GypcQ78HU7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GypcQ78HU7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GypcQ78HU7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GypcQ78HU7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GypcQ78HU7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GypcQ78HU7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GypcQ78HU7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GypcQ78HU7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GypcQ78HU7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GypcQ78HU7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GypcQ78HU7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GypcQ78HU7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GypcQ78HU7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GypcQ78HU7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GypcQ78HU7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GypcQ78HU7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GypcQ78HU7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GypcQ78HU7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GypcQ78HU7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GypcQ78HU7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GypcQ78HU7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GypcQ78HU7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GypcQ78HU7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GypcQ78HU7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GypcQ78HU7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GypcQ78HU7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GypcQ78HU7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GypcQ78HU7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GypcQ78HU7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GypcQ78HU7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GypcQ78HU7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GypcQ78HU7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GypcQ78HU7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GypcQ78HU7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GypcQ78HU7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GypcQ78HU7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GypcQ78HU7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GypcQ78HU7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GypcQ78HU7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GypcQ78HU7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GypcQ78HU7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GypcQ78HU7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GypcQ78HU7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GypcQ78HU7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GypcQ78HU7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GypcQ78HU7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GypcQ78HU7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GypcQ78HU7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GypcQ78HU7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GypcQ78HU7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GypcQ78HU7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GypcQ78HU7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GypcQ78HU7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GypcQ78HU7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GypcQ78HU7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GypcQ78HU7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GypcQ78HU7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GypcQ78HU7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GypcQ78HU7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GypcQ78HU7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GypcQ78HU7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GypcQ78HU7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GypcQ78HU7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GypcQ78HU7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GypcQ78HU7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GypcQ78HU7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GypcQ78HU7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GypcQ78HU7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GypcQ78HU7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GypcQ78HU7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GypcQ78HU7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GypcQ78HU7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GypcQ78HU7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GypcQ78HU7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GypcQ78HU7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GypcQ78HU7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GypcQ78HU7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GypcQ78HU7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GypcQ78HU7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GypcQ78HU7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GypcQ78HU7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GypcQ78HU7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GypcQ78HU7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GypcQ78HU7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GypcQ78HU7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GypcQ78HU7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GypcQ78HU7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GypcQ78HU7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GypcQ78HU7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GypcQ78HU7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms