Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms