Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms