Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms