Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NinlQ6ZQ12 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NinlQ6ZQ12 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NinlQ6ZQ12 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NinlQ6ZQ12 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NinlQ6ZQ12 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NinlQ6ZQ12 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NinlQ6ZQ12 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NinlQ6ZQ12 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NinlQ6ZQ12 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NinlQ6ZQ12 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NinlQ6ZQ12 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NinlQ6ZQ12 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NinlQ6ZQ12 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NinlQ6ZQ12 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NinlQ6ZQ12 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NinlQ6ZQ12 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NinlQ6ZQ12 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NinlQ6ZQ12 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NinlQ6ZQ12 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NinlQ6ZQ12 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NinlQ6ZQ12 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NinlQ6ZQ12 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NinlQ6ZQ12 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NinlQ6ZQ12 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NinlQ6ZQ12 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NinlQ6ZQ12 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NinlQ6ZQ12 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NinlQ6ZQ12 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NinlQ6ZQ12 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NinlQ6ZQ12 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NinlQ6ZQ12 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NinlQ6ZQ12 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NinlQ6ZQ12 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NinlQ6ZQ12 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NinlQ6ZQ12 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NinlQ6ZQ12 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NinlQ6ZQ12 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NinlQ6ZQ12 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NinlQ6ZQ12 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NinlQ6ZQ12 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NinlQ6ZQ12 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NinlQ6ZQ12 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NinlQ6ZQ12 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NinlQ6ZQ12 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NinlQ6ZQ12 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NinlQ6ZQ12 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NinlQ6ZQ12 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NinlQ6ZQ12 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NinlQ6ZQ12 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NinlQ6ZQ12 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NinlQ6ZQ12 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NinlQ6ZQ12 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NinlQ6ZQ12 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NinlQ6ZQ12 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NinlQ6ZQ12 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
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