Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPI3

Lcor, Ligand-dependent corepressor, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorQ6ZPI3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LcorQ6ZPI3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LcorQ6ZPI3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LcorQ6ZPI3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LcorQ6ZPI3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LcorQ6ZPI3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LcorQ6ZPI3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LcorQ6ZPI3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LcorQ6ZPI3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LcorQ6ZPI3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LcorQ6ZPI3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LcorQ6ZPI3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LcorQ6ZPI3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LcorQ6ZPI3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LcorQ6ZPI3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms