Protein–RNA interactions for Protein: Q6VZZ7

Opn5, Opsin-5, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn5Q6VZZ7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn5Q6VZZ7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn5Q6VZZ7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn5Q6VZZ7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn5Q6VZZ7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn5Q6VZZ7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn5Q6VZZ7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn5Q6VZZ7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn5Q6VZZ7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn5Q6VZZ7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn5Q6VZZ7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn5Q6VZZ7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn5Q6VZZ7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn5Q6VZZ7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn5Q6VZZ7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn5Q6VZZ7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn5Q6VZZ7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn5Q6VZZ7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn5Q6VZZ7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn5Q6VZZ7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn5Q6VZZ7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn5Q6VZZ7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn5Q6VZZ7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn5Q6VZZ7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn5Q6VZZ7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn5Q6VZZ7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn5Q6VZZ7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn5Q6VZZ7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn5Q6VZZ7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn5Q6VZZ7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn5Q6VZZ7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn5Q6VZZ7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn5Q6VZZ7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn5Q6VZZ7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn5Q6VZZ7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn5Q6VZZ7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn5Q6VZZ7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn5Q6VZZ7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn5Q6VZZ7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn5Q6VZZ7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn5Q6VZZ7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn5Q6VZZ7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn5Q6VZZ7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn5Q6VZZ7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn5Q6VZZ7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn5Q6VZZ7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn5Q6VZZ7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn5Q6VZZ7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn5Q6VZZ7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn5Q6VZZ7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn5Q6VZZ7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn5Q6VZZ7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn5Q6VZZ7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn5Q6VZZ7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn5Q6VZZ7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn5Q6VZZ7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn5Q6VZZ7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn5Q6VZZ7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn5Q6VZZ7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn5Q6VZZ7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms