Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms