Protein–RNA interactions for Protein: Q6V4S5

Sdk2, Protein sidekick-2, mousemouse

Predictions only

Length 2,176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdk2Q6V4S5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sdk2Q6V4S5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sdk2Q6V4S5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sdk2Q6V4S5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sdk2Q6V4S5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sdk2Q6V4S5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sdk2Q6V4S5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sdk2Q6V4S5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sdk2Q6V4S5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sdk2Q6V4S5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sdk2Q6V4S5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sdk2Q6V4S5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sdk2Q6V4S5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sdk2Q6V4S5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sdk2Q6V4S5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sdk2Q6V4S5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sdk2Q6V4S5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sdk2Q6V4S5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdk2Q6V4S5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdk2Q6V4S5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdk2Q6V4S5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdk2Q6V4S5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdk2Q6V4S5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdk2Q6V4S5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdk2Q6V4S5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdk2Q6V4S5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdk2Q6V4S5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdk2Q6V4S5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdk2Q6V4S5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdk2Q6V4S5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdk2Q6V4S5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdk2Q6V4S5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdk2Q6V4S5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdk2Q6V4S5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdk2Q6V4S5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdk2Q6V4S5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdk2Q6V4S5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdk2Q6V4S5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdk2Q6V4S5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdk2Q6V4S5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sdk2Q6V4S5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdk2Q6V4S5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdk2Q6V4S5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdk2Q6V4S5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdk2Q6V4S5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdk2Q6V4S5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdk2Q6V4S5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdk2Q6V4S5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdk2Q6V4S5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdk2Q6V4S5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdk2Q6V4S5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdk2Q6V4S5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdk2Q6V4S5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdk2Q6V4S5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdk2Q6V4S5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdk2Q6V4S5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdk2Q6V4S5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdk2Q6V4S5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdk2Q6V4S5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdk2Q6V4S5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdk2Q6V4S5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdk2Q6V4S5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdk2Q6V4S5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdk2Q6V4S5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdk2Q6V4S5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdk2Q6V4S5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdk2Q6V4S5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdk2Q6V4S5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdk2Q6V4S5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdk2Q6V4S5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdk2Q6V4S5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdk2Q6V4S5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdk2Q6V4S5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdk2Q6V4S5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdk2Q6V4S5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdk2Q6V4S5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdk2Q6V4S5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdk2Q6V4S5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdk2Q6V4S5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdk2Q6V4S5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdk2Q6V4S5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdk2Q6V4S5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdk2Q6V4S5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdk2Q6V4S5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdk2Q6V4S5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdk2Q6V4S5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdk2Q6V4S5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdk2Q6V4S5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdk2Q6V4S5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdk2Q6V4S5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdk2Q6V4S5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdk2Q6V4S5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdk2Q6V4S5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdk2Q6V4S5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdk2Q6V4S5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdk2Q6V4S5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdk2Q6V4S5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdk2Q6V4S5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdk2Q6V4S5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdk2Q6V4S5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms