Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Gja6Q6S5G4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Gja6Q6S5G4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Gja6Q6S5G4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gja6Q6S5G4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gja6Q6S5G4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gja6Q6S5G4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gja6Q6S5G4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gja6Q6S5G4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gja6Q6S5G4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gja6Q6S5G4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gja6Q6S5G4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gja6Q6S5G4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gja6Q6S5G4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gja6Q6S5G4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gja6Q6S5G4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gja6Q6S5G4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gja6Q6S5G4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gja6Q6S5G4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gja6Q6S5G4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gja6Q6S5G4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gja6Q6S5G4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gja6Q6S5G4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gja6Q6S5G4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gja6Q6S5G4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gja6Q6S5G4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gja6Q6S5G4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gja6Q6S5G4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gja6Q6S5G4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gja6Q6S5G4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gja6Q6S5G4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gja6Q6S5G4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gja6Q6S5G4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gja6Q6S5G4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gja6Q6S5G4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gja6Q6S5G4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms