Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms