Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms