Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms