Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX7

Rgma, Repulsive guidance molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmaQ6PCX7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RgmaQ6PCX7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RgmaQ6PCX7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RgmaQ6PCX7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RgmaQ6PCX7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RgmaQ6PCX7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RgmaQ6PCX7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RgmaQ6PCX7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms