Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAL0

Bend3, BEN domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bend3Q6PAL0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Bend3Q6PAL0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Bend3Q6PAL0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Bend3Q6PAL0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Bend3Q6PAL0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bend3Q6PAL0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bend3Q6PAL0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bend3Q6PAL0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bend3Q6PAL0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bend3Q6PAL0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bend3Q6PAL0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bend3Q6PAL0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bend3Q6PAL0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bend3Q6PAL0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bend3Q6PAL0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bend3Q6PAL0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bend3Q6PAL0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Bend3Q6PAL0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bend3Q6PAL0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bend3Q6PAL0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bend3Q6PAL0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bend3Q6PAL0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bend3Q6PAL0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bend3Q6PAL0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bend3Q6PAL0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bend3Q6PAL0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bend3Q6PAL0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bend3Q6PAL0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Bend3Q6PAL0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bend3Q6PAL0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bend3Q6PAL0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bend3Q6PAL0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Bend3Q6PAL0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Bend3Q6PAL0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Bend3Q6PAL0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bend3Q6PAL0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bend3Q6PAL0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bend3Q6PAL0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bend3Q6PAL0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Bend3Q6PAL0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Bend3Q6PAL0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bend3Q6PAL0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bend3Q6PAL0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bend3Q6PAL0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Bend3Q6PAL0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bend3Q6PAL0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bend3Q6PAL0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bend3Q6PAL0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bend3Q6PAL0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Bend3Q6PAL0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bend3Q6PAL0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bend3Q6PAL0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bend3Q6PAL0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bend3Q6PAL0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bend3Q6PAL0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bend3Q6PAL0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bend3Q6PAL0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bend3Q6PAL0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bend3Q6PAL0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bend3Q6PAL0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bend3Q6PAL0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bend3Q6PAL0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bend3Q6PAL0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bend3Q6PAL0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bend3Q6PAL0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms