Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms