Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9K9

Nrxn3, Neurexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrxn3Q6P9K9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nrxn3Q6P9K9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nrxn3Q6P9K9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nrxn3Q6P9K9 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nrxn3Q6P9K9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nrxn3Q6P9K9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nrxn3Q6P9K9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nrxn3Q6P9K9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nrxn3Q6P9K9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nrxn3Q6P9K9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nrxn3Q6P9K9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nrxn3Q6P9K9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nrxn3Q6P9K9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nrxn3Q6P9K9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nrxn3Q6P9K9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nrxn3Q6P9K9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nrxn3Q6P9K9 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nrxn3Q6P9K9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nrxn3Q6P9K9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nrxn3Q6P9K9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nrxn3Q6P9K9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nrxn3Q6P9K9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nrxn3Q6P9K9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nrxn3Q6P9K9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nrxn3Q6P9K9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nrxn3Q6P9K9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nrxn3Q6P9K9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nrxn3Q6P9K9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nrxn3Q6P9K9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nrxn3Q6P9K9 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nrxn3Q6P9K9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nrxn3Q6P9K9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nrxn3Q6P9K9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nrxn3Q6P9K9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nrxn3Q6P9K9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nrxn3Q6P9K9 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nrxn3Q6P9K9 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Nrxn3Q6P9K9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nrxn3Q6P9K9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nrxn3Q6P9K9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nrxn3Q6P9K9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nrxn3Q6P9K9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Nrxn3Q6P9K9 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nrxn3Q6P9K9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nrxn3Q6P9K9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nrxn3Q6P9K9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nrxn3Q6P9K9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nrxn3Q6P9K9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nrxn3Q6P9K9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nrxn3Q6P9K9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nrxn3Q6P9K9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nrxn3Q6P9K9 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Nrxn3Q6P9K9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nrxn3Q6P9K9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Nrxn3Q6P9K9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nrxn3Q6P9K9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nrxn3Q6P9K9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nrxn3Q6P9K9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nrxn3Q6P9K9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nrxn3Q6P9K9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nrxn3Q6P9K9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nrxn3Q6P9K9 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nrxn3Q6P9K9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nrxn3Q6P9K9 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nrxn3Q6P9K9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nrxn3Q6P9K9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nrxn3Q6P9K9 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Nrxn3Q6P9K9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nrxn3Q6P9K9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nrxn3Q6P9K9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nrxn3Q6P9K9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nrxn3Q6P9K9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nrxn3Q6P9K9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nrxn3Q6P9K9 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nrxn3Q6P9K9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nrxn3Q6P9K9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nrxn3Q6P9K9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nrxn3Q6P9K9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nrxn3Q6P9K9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nrxn3Q6P9K9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nrxn3Q6P9K9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Nrxn3Q6P9K9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nrxn3Q6P9K9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nrxn3Q6P9K9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nrxn3Q6P9K9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nrxn3Q6P9K9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Nrxn3Q6P9K9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nrxn3Q6P9K9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Nrxn3Q6P9K9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nrxn3Q6P9K9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Nrxn3Q6P9K9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nrxn3Q6P9K9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nrxn3Q6P9K9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nrxn3Q6P9K9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nrxn3Q6P9K9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nrxn3Q6P9K9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nrxn3Q6P9K9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Nrxn3Q6P9K9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nrxn3Q6P9K9 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nrxn3Q6P9K9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms