Protein–RNA interactions for Protein: Q6P7W5

Tsen2, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen2, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsen2Q6P7W5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tsen2Q6P7W5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms