Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U7

Nwd2, NACHT and WD repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nwd2Q6P5U7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nwd2Q6P5U7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nwd2Q6P5U7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nwd2Q6P5U7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nwd2Q6P5U7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Nwd2Q6P5U7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nwd2Q6P5U7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nwd2Q6P5U7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nwd2Q6P5U7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nwd2Q6P5U7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nwd2Q6P5U7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nwd2Q6P5U7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nwd2Q6P5U7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nwd2Q6P5U7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nwd2Q6P5U7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nwd2Q6P5U7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nwd2Q6P5U7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nwd2Q6P5U7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nwd2Q6P5U7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nwd2Q6P5U7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nwd2Q6P5U7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nwd2Q6P5U7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nwd2Q6P5U7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nwd2Q6P5U7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nwd2Q6P5U7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nwd2Q6P5U7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nwd2Q6P5U7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nwd2Q6P5U7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nwd2Q6P5U7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nwd2Q6P5U7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nwd2Q6P5U7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nwd2Q6P5U7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nwd2Q6P5U7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nwd2Q6P5U7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nwd2Q6P5U7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nwd2Q6P5U7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Nwd2Q6P5U7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nwd2Q6P5U7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nwd2Q6P5U7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nwd2Q6P5U7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nwd2Q6P5U7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nwd2Q6P5U7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Nwd2Q6P5U7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Nwd2Q6P5U7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nwd2Q6P5U7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nwd2Q6P5U7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nwd2Q6P5U7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms