Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5E6

Gga2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga2Q6P5E6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gga2Q6P5E6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gga2Q6P5E6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gga2Q6P5E6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gga2Q6P5E6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gga2Q6P5E6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gga2Q6P5E6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gga2Q6P5E6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gga2Q6P5E6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gga2Q6P5E6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gga2Q6P5E6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gga2Q6P5E6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gga2Q6P5E6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gga2Q6P5E6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gga2Q6P5E6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gga2Q6P5E6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms